由於上人有感於「貧因病起，病由貧生」，尤以東部山川重阻，缺乏完善的醫療設施，民眾由小病釀成大病，甚至枉送性命者時有所聞。在上人思索：生命尊嚴，平等無異；為服務東部病患，解決貧困的根源，乃於68年間，毅然發起建院，希能延續佛教的精神慧命於永久。佛教慈濟醫院為提升東部研究能量，於民國108年8月成立心血管暨粒線體相關疾病研究中心，期望能從癌症與心血管疾病著手，並結合轉譯醫學、醫學工程、生命科學與幹細胞學為基礎，來探討疾病與老化相關研究的機制，同時培養高齡化社會到來所需老化相關醫療研究人才。此外，本中心亦著重中西醫合療的研究，期望將數千年中草藥治療功效，以現代化科學加以證明並推廣其應用。