西元1986年8月17日，在萬方矚目下，佛教慈濟綜合醫院正式落成啟業。禮聘前台大醫院副院長杜詩棉教授為院長，曾文賓教授為副院長；並與台大 醫院建教合作，醫師陣容堪稱壯盛。

硬體建築即將完成，在西元1985年元月，慈濟醫院第一次公開登報招考醫師時 ，除了牙科有兩位醫師前來外，其他科竟無人報考；慈院籌建委員會委員，時任台大醫院院長的楊思標教授，與時任台大醫院副院 長的杜詩綿教授咸認為，慈院唯有和台大醫院建教合作，開業初期的醫師來源才不致中斷；終在當時台大醫院外科陳楷模主任大力協助下，才有第一位台大醫院的陳英和醫師應允前來；但各科之主治醫師仍十分難尋；開業初期仍以輪調方式，由台大醫院醫師支援。

醫院的興建，除了幕款、土地等問題，硬體的建築及醫護、醫技人員的尋覓，在在皆是困難重重。西元1981年10月，慈濟開始公開徵求醫院建築籃圖及建築師，終於決定由 許常吉建築師 負責。

醫院籌建之初，預估第一期工程費需新台幣八億元，動工之際僅籌募到三千餘萬元。由於各項工程，籌建委員會均能一本『 誠 』、 『 正 』精神，深獲各方信賴，海內外捐款源源而來。