長久以來大家都認為大豆異黃酮因為雌激素的結構相似，應該也具有增加骨質密度的作用。但對大豆異黃酮的用量和安全性卻沒有共識，2020年6月國際骨質疏鬆期刊(Osteoporosis International)表示大豆異黃酮中金雀黃酮(genistein) 每日量54 mg或骨黃酮(ipriflavone) 每日量600 mg將有助提高骨質密度，可作為停經婦女選用大豆異黃酮參考。至於大豆異黃酮的來源無論是來自合成或天然食物都具有同樣的效果。

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