證嚴法師在一九六六年創立佛教克難慈濟功德會，開始從事濟貧救苦。期間，因見花東地區普遍貧窮，民眾生病經常捨不得花錢就醫，往往小感冒就延誤成大病，遂在花蓮醫院數位醫護人員支持下，成立「貧民施醫義診所」，每周兩次義診施藥，並定期巡迴花東地區舉辦義診。

證嚴法師在濟貧過程深感「貧病相生」，於一九七九年發起籌建醫院。一九八六年八月十七日慈濟醫院正式啟業，秉持「尊重生命」理念，在花東地區落實「以病人為中心」的醫療照顧。在醫療團隊的努力下，醫療品質和服務質量上不斷提升。

一九九九年開始，玉里、關山、大林、臺北、臺中等分院陸續啟業，在臺灣北、中、南、東區域設立據點，建構完整綿密的慈濟醫療網絡。從急性醫療到慢性醫療，以迄醫學研究的推動，從都市到鄉村、由山巔到水涯，為民眾提供尖端科技與人文關懷並重的完善醫療服務。

二○○○年三月花蓮慈濟醫院通過ISO國際認證，二○○二年晉升為東台灣唯一的醫學中心，是緊急醫療救護(EMS)系統的基地醫院，也是花東地區的「後 送醫院」，承擔了大部分的急、重症病人。承接衛生署「東部地區緊急醫療災難應變指揮中心(EOC)」，其中又包含毒藥物諮詢中心、毒化災協調中心及災難醫 療救護隊指揮中心，使慈院具有全方位功能，有能力應付任何的災難，守護生命。

二○一○年八月花蓮慈濟醫院再次成為通過ISO9001：2008驗證，不但是首家通過ISO國際品質保證驗證的醫學中心，更獲得台灣檢驗科技股份有限公司（SGS）頒發標竿獎表揚，而這也是台灣首例由醫療機構獲得標竿獎的榮譽。

二十五年來，慈濟醫院本著「人本醫療，尊重生命」的創院宗旨，提供最佳醫療與服務品質，守護生命與健康。慈濟醫療揉合「愛與人文」，以十「C」為經營策略──
1. Convenient: Tender Caring（溫馨體恤：方便）；
2. Comfortable: Barrier-Free （自在無礙：舒適性）；
3. Complete: Holistic Service  （服務全方位：完整的服務）；
4. Continual: Never-ceasing Medical Service （醫療不打烊：連續性醫療運作的概念）；
5. Comprehensive: Peace and Joy for Body, Mind, and Soul（身心皆安樂：整體性的照顧）；
6. Conservational: Mindful Love for Earth（用心愛大地）；
7. Computer-Based: Technology as Pioneer（科技作先鋒：資訊化）；
8. Cost-Effective: Sustainable Management（永續經營：有效益的）；
9. Compassionate: Never Ending Love（愛無止境：愛心的服務）；
10.Community-Oriented: Friendly Neighborhood（好厝邊：以社區為導向）。
 

近幾年來，慈濟醫院全力推動「健康促進醫院」，並針對領導管理、病人家屬、社區、同仁、環境與心靈健康等六大主軸多管並進，努力營造。要讓病者重獲健康，無病者維持健康，更重要的是讓社區的健康促進成為一種常態，讓民眾的身心靈都健康。

2011年7月26日下午，由林俊龍執行長與高瑞和副院長代表全體同仁接受「台灣百大品牌」頒獎典禮。兩人在接受採訪時表示，非常感恩鄉親對慈濟醫院的 肯定，更感恩四分之一世紀以來，所有慈濟志工的一路陪伴，獲得台灣百大品牌的肯定，也愈顯慈濟的醫療重任，醫療團隊將更努力承擔守護鄉親、守護生命、守護 健康的任務。

詳情請看:http://100.brandingtaiwan.org/index.php?act=classx&class=22&lag=